Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Abcg3Q99P81 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abcg3Q99P81 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms