Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NsmfQ99NF2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms