Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bco2Q99NF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bco2Q99NF1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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