Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a6dQ99N07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6dQ99N07 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms