Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd1Q99MV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd1Q99MV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.2 ms