Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KarsQ99MN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KarsQ99MN1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms