Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm2d1Q99MB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm2d1Q99MB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms