Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epdr1Q99M71 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epdr1Q99M71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms