Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bp5lQ99LH9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp5lQ99LH9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms