Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DhddsQ99KU1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DhddsQ99KU1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms