Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls3Q99K51 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Pls3Q99K51 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pls3Q99K51 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pls3Q99K51 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pls3Q99K51 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pls3Q99K51 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pls3Q99K51 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms