Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY0

Hadhb, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhbQ99JY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HadhbQ99JY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HadhbQ99JY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms