Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn3Q99JH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clstn3Q99JH7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms