Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctu1Q99J10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctu1Q99J10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctu1Q99J10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms