Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atad3Q925I1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms