Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo1Q924W9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo1Q924W9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms