Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nrif1Q923B3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nrif1Q923B3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms