Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf3Q922U1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf3Q922U1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf3Q922U1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms