Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb6Q922F4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb6Q922F4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb6Q922F4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms