Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf7Q922B6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf7Q922B6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf7Q922B6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms