Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b3Q921M3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms