Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi2Q920Q6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi2Q920Q6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms