Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms