Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1bQ91YK2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1bQ91YK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1bQ91YK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms