Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atl3Q91YH5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms