Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna2Q91X60 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna2Q91X60 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms