Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2cQ91VK4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2cQ91VK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms