Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NifkQ91VE6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms