Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H1fooQ8VIK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H1fooQ8VIK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms