Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacng8Q8VHW2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng8Q8VHW2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng8Q8VHW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms