Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppargc1bQ8VHJ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms