Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd49Q8VE42 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ankrd49Q8VE42 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ankrd49Q8VE42 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms