Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Washc1Q8VDD8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Washc1Q8VDD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Washc1Q8VDD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms