Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn4Q8VCH8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms