Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajc28Q8VCE1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc28Q8VCE1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms