Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm4cQ8VCD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms