Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp3Q8R4B8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrp3Q8R4B8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms