Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf3Q8R3J4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf3Q8R3J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mterf3Q8R3J4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms