Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga1Q8R0H9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gga1Q8R0H9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms