Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GabrpQ8QZW7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GabrpQ8QZW7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GabrpQ8QZW7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms