Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdk5rap2Q8K389 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdk5rap2Q8K389 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms