Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Champ1Q8K327 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Champ1Q8K327 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Champ1Q8K327 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms