Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stn1Q8K2X3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms