Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paf1Q8K2T8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms