Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Commd9Q8K2Q0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd9Q8K2Q0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms