Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrrdQ8K2M3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrrdQ8K2M3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms