Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Depp1Q8K2F3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms