Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd3Q8K2F0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms