Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colgalt1Q8K297 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colgalt1Q8K297 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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