Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neil3Q8K203 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neil3Q8K203 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms